一、本罪与一般专利侵权行为的界限
本条明文规定只有“情节严重”的假冒专利行为才构成犯罪，否则不构成犯罪，而只是一般的民事侵权行为，应按照专利法定处理，不以犯罪论处。专利权人或者利害关系人可以请求专利管理机关进行处理或者直接向人民法院起诉。专利管理机关处理假冒他人专利案件，有权责令侵权人停止侵权行为，并赔偿损失。人民法院受理专利权人或者利害关系人起诉的侵害专利权的案件，可以判决或者裁定停止侵害、赔偿损失，还可以予以收缴进行侵害的工具和非法所得，并可以依照法律规定予以罚款、拘留。至于如何认定假冒他人专利情节严重，实践中应结合犯罪的主客观因素和后果等进行综合分析和判断。
二、本罪与假冒注册商标罪的界限
二者特征基本相同，客观上都有假冒行为，主观上都是故意犯罪，目的一般都是为了牟取非法利益，主体相同。二者主要区别表现在：
1 、侵害的客体不同。假冒专利罪侵犯的直接客体是国家的专利管理制度，而假冒商标罪侵犯的直接客体是国家的商标管理制度。
2 、假冒专利罪的侵害对象不是注册商标，而是被授予的专利。这也是二者在假冒内容上的差别。
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